芽孢是一种特殊的结构，它形成的体质具有很强的折光性，为了避免不利的环境，不易着色。它在结构和化学成分上与无性系细胞不同，具有许多不同于无性系细胞的特点。对高温、紫外线、干燥、电离辐射和许多有毒化学物质有很强的抵抗力，被称为生物界中最抗压的生物体。
芽孢难以杀死的原因是它的特殊结构。芽孢赋予细菌对各种物理和化学因素（如热、干燥、辐射、化学消毒剂等）的强大抵抗力，使细菌能够在恶劣的环境中保持长期活性。如果消毒不*，在适当的条件下，芽孢可以还原成细菌。它从外到内的结构是这样的。重要的是：它由芽孢壁、芽孢膜、芽孢物质和核区四部分组成，含水量极低。
1、芽孢外壁：主要由脂蛋白组成，通透性差。
2、芽孢外皮：主要含有疏水性的角蛋白。
3、皮层。皮层非常厚，约占芽孢总体积的一半。它主要含有芽孢的肽聚糖和DPA-CA，使芽孢具有异常的耐热性。皮层的渗透压非常高。
芽孢的存在足以构成一个重要的因素，威胁到清洁区的微生物验证的不符合性。芽孢是否能被杀死是衡量各种消毒和灭菌的最重要指标。
实验室芽孢消毒剂使用的氧化剂是过氧化氢，它与稳定剂结合形成复合溶液。加入的微量银离子作为催化剂可以保持长期的有效性。银离子的杀菌作用是基于单价银离子通过共价键和配位键与细菌蛋白质牢固结合，使细菌失活或沉淀。从而达到*杀菌的效果，并可取代现有的甲醛熏蒸。
